Источник: Lancet

Резюме

Справочная информация

Курение влияет на метилирование ДНК, однако отсутствуют данные о дифференцированном метилировании в зависимости от пола или рациона питания, недавнего отказа от курения (<1 года), сохранения дифференцированного метилирования в результате внутриутробного воздействия курения, а также влияния табачного дыма на окружающую среду (ETS).

Методы

Мы провели метаанализ данных 15 014 взрослых из 5 когорт с измерением метилирования ДНК в крови с помощью набора Illumina EPIC на предмет текущего курения (2560 человек), отказа от курения менее 1 года (500 человек), внутриутробного курения (286 человек) и воздействия ETS (676 человек). Мы также оценили взаимосвязь текущего курения с полом или рационом питания (клетчатка, фолаты и витамин С).

Результаты

При использовании коэффициента ложного обнаружения (FDR < 0,05) 65 857 CpG были дифференцированно метилированы в зависимости от текущего курения, 4025 — от недавнего отказа от курения, 594 — от внутриутробного воздействия и 6 — от воздействия ETS. Большинство CpG, связанных с курением, ослабевают в течение года после отказа от курения. CpG, связанные с внутриутробным воздействием у взрослых, были обогащены теми, которые ранее наблюдались у новорожденных. Дифференциальное метилирование под влиянием текущего курения в 4-71 CpG может зависеть от пола или рациона питания. Почти половина (35-50 %) дифференциально метилированных CpG на массиве 450 K была связана с экспрессией генов в крови. Метилирование CpGs при курении и внутриутробном курении выявило 3049 и 1067 лекарственных мишеней, включая химиотерапевтические препараты.

Интерпретация

С помощью массива EPIC компании Illumina было выявлено множество сайтов метилирования, связанных с курением. Большинство сигналов возвращаются к уровням, наблюдаемым у никогда не куривших людей в течение года после отказа от курения. Многие CpG, связанные с курением в утробе матери, сохраняются во взрослом возрасте. Связанные с курением лекарственные мишени могут дать представление о реакции на лечение рака и общих механизмах развития заболеваний, связанных с курением.

Финансирование

Программа интрамуральных исследований Национальных институтов здравоохранения, Министерство здравоохранения и медицинского обслуживания Норвегии и Министерство образования и научных исследований, Управление главного ученого директората здравоохранения правительства Шотландии и Шотландский совет по финансированию, Совет по медицинским исследованиям Великобритании и Wellcome Trust.

С полным текстом отчёта об исследовании можно ознакомиться в журнале The Lancet